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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
京港澳高速公路湖北省北段改扩建工程开工******
中新网武汉1月10日电 (肖帆 刘欣 王江陵)京港澳高速公路鄂豫界至君山段改扩建工程湖北孝感段10日正式开工，至此京港澳高速公路湖北省北段正式全线新建。项目建成后，将由目前的4车道变成8车道。
京港澳高速公路湖北北段改扩建工程，起于孝感市大悟县九里关，与京港澳高速公路河南段对接，止于武汉西枢纽互通衔接京港澳高速公路与沪渝高速公路共线段，全长158公里，投资规模约216亿元，是目前湖北省工程规模最大、投资金额最高的单一高速公路改扩建项目。
该工程按全部控制出入、全立交的8车道高速公路标准进行改扩建，设计速度120公里/小时，全线共设桥梁29228.94米/202座、互通式立体交叉16处，服务区4处，停车区2处。
京港澳高速公路改扩建工程湖北孝感段紧邻高速公路施工 肖帆 摄当天的开工活动，在中铁十一局集团担负施工的第4标段进行。该标段包含一期18.7公里的土建、二期35.9公里路面工程。中铁十一局项目负责人介绍，京港澳高速公路作为贯通中国南北交通大动脉之一，道路交通异常繁忙，这对施工安全、施工进度等领域提出挑战，本次改扩建施工将在不影响道路通行的情况下进行。
据悉，京港澳高速湖北段改扩建工程建成后将进一步缓解京港澳高速公路交通压力，畅通南北交通大动脉，强化武汉市综合交通枢纽功能，同时，还将完善湖北省高速公路网路结构。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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